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Courses and slides

 

Cours sur l’imagerie de diffusion par résonance magnétique nucléaire : de l’acquisition à l’analyse des données

Une série de 4 cours de 2h sur l’imagerie par résonance magnétique du processus de diffusion cérébrale diffusion et de 4 TP de 2h sur la nouvelle boîte à outil de traitement des données de diffusion Connectomist2 de la plateforme logicielle BrainVISA de l’I²BM est organisée en 2010 au sein du centre NeuroSpin et ouverte à tous.

Les cours auront lieu aux dates suivantes en salle 185 :

  • vendredi 5 novembre 2010 de 9h00 à 11h00
  • vendredi 19 novembre 2010 de 9h00 à 11h00
  • vendredi 26 novembre 2010 de 9h00 à 11h00
  • vendredi 3 décembre 2010 de 9h00 à 11h00

Les TPs auront lieu aux dates suivantes :

  • vendredi 10 décembre 2010 de 9h00 à 11h00
  • vendredi 7 janvier 2010 de 9h00 à 11h00
  • vendredi 14 janvier 2010 de 9h00 à 11h00
  • vendredi 21 janvier 2010 de 9h00 à 11h00

Sont couverts les points théoriques suivants :

  • la physique du processus de diffusion de l’eau cérébrale
  • rendre le signal de résonance magnétique nucléaire sensible au processus de diffusion
  • quels sont les paramètres à régler lors de la mise au point d’un protocole d’imagerie
  • la modélisation locale du processus et l’accès aux informations de distribution d’orientation locale du tissu, de propagateur d’ensemble moyen, de calibration des tailles/densités des cellules
  • connectivité anatomique cérébrale : le connectome humain, les techniques de tractographie, leurs applications et leurs limites
  • application basées sur la connaissance des profils de connectivité anatomique : clustering de fibres, parcélisation du cortex en aires, connectivité striato-corticale
  • applications émergentes de l’imagerie de diffusion : calibration axonale, imagerie de diffusion fonctionnelle, spectroscopie de diffusion des métabolites

et les points pratiques suivants :

  • quel protocole pour quelle application (ie quelle b-value, combien d’orientations, combien de shells, quel modèle local choisir, quel type de tractographie choisir)
  • prétraitement des données de diffusion et correction des artéfacts (courants de Foucault, effets de susceptbilité, non linéarités des gradients, mouvement, spikes,…)
  • la nouvelle toolbox connectomist2 : présentation globale
  • la nouvelle toolbox connectomist2 : TP sur un jeu de données de la base Archi
 

Cours d’IRM de diffusion - Partie I
Fichier PDF - 3.7 Mo

Cours d’IRM de diffusion - Partie II
Fichier PDF - 3.6 Mo

Cours d’IRM de diffusion - Partie III
Fichier PDF - 3.5 Mo

Cours d’IRM de diffusion - Partie IV
Fichier PDF - 3.7 Mo

Réunion scientifique NeuroSpin - 28 Mars 2011 - Présentation du futur projt d’imagerie à haute résolution (7T) chez le babouin - projet transversal LRMN/LBI/LNAO
Fichier PDF - 2.3 Mo
 
 
Publié le lundi 15 novembre 2010

 
 
 
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  Mis à jour le vendredi 21 mars 2014